怀孕三周可以根据医生指导使用药物流产。使用药物流产需要在怀孕50天之前进行使用,并且是在确定宫内孕之后,才可以使用药物流产。在使用药物流产之前,需要做身体的全面检查,并且通过B超检查胚胎的发育大小,如果胚胎发育过大,是不建议使用药物流产的。在使用药物流产之后,需要多注意身体的变化以及阴道的情况。如果出现阴道大出血,需要及时到医院咨询相关的医生,并且根据医生的指导进行相应的治疗,千万不要拖拉,以免造成生命危险。