怀孕40天阴道有褐色分泌物流出,这不属于正常现象,需要格外注意。褐色分泌物说明有出血情况,这有可能是先兆流产的反应,也可能是由于子宫肌瘤、子宫内膜息肉、子宫内膜炎等妇科问题影响了胎儿发育所导致的。也可能是怀孕后情绪不稳定,经常熬夜、休息不好,饮食不均衡导致的卵巢黄体功能不全或孕酮分泌不足造成的。无论是什么原因导致的,都建议要及时就医检查,以便及早治疗。