长跑后出现头疼的原因包括原发性的和继发性的。原发性的病因目前尚不明确,主要与偏头痛有关系,运动后人体会感觉到身体发热,出现血管扩张,心输出量增大,整个机体的血容量增加,刺激到脑部血管的疼痛感受器,出现头晕,头疼等症状。此外,长跑后也会引起颅内压的上升,脱水、低血糖、疲劳等,也会出现头疼的症状。建议缓慢增加运动量,长期严重持续者,进行必要的鉴别诊断以确定头痛的病因。