卵巢早衰多数患者无明确病因,只能依靠一些辅助检查帮助诊断。卵巢早衰的病因机制不完全明确,包括家族遗传史、自身免疫性疾病、腮腺炎及结核病史、盆腔感染病史等;盆腔肿瘤放射、化疗及盆腔手术等医源性损伤史;吸烟饮酒不良习惯、有毒有害物质接触史;在发病前有持续不良的精神刺激史等。有助于诊断的检查包括基础性激素水平测定、抑制素水平测定、骨密度测定、抗苗勒氏管激素的测定、自身免疫指标和内分泌功能测定等,遗传学检查和卵巢活检也可用于病因学的研究。