怀孕五十天有褐色分泌物,需注意若是还有分泌物呈红色的,伴有小腹下坠疼,需要去医院检查,考虑有先兆流产的可能,可以在医生指导下用药保胎。建议可以抽血检查孕酮,看是否因孕酮过低而引起的流产。另外再做彩超的检查,观察此时胚胎发育的情况,正常的怀孕五十天应有胎心、胎芽、卵黄囊等。要是检查结果没有以上的情况,考虑可能是胚胎停育,或是发育不良等引起的。若只是单纯的孕酮过低,遵医嘱补充孕酮药物来保胎治疗,同时需要卧床休息。