子宫囊肿和子宫肌瘤主要的区别在于生长部位、性质、诱因等。子宫囊肿通常是指子宫颈腺囊肿,这属于慢性子宫颈炎的病理表现,慢性炎症刺激引起腺管口堵塞,导致腺体分泌物引流受阻,潴留形成的囊肿,通常表现为液性包块。子宫肌瘤是由平滑肌及结缔组织组成的良性肿瘤,生长在肌壁间、浆膜下以及黏膜下,与雌激素生长密切相关。如果有内分泌紊乱,诱发子宫肌瘤的风险相对较大,通常在育龄期女性发病率较高。子宫囊肿通常不会恶变,但子宫肌瘤有可能会发生肉瘤样变,但相对少见。