囊肿是否影响月经要根据囊肿的位置、大小、性质判断。囊肿位于宫颈部位且囊肿过大,则会导致经血引流不畅,严重者会引起痛经等表现。囊肿为宫腔壁上,如果过大可能会影响月经。当囊肿多发且大位于卵巢时,这样的囊肿是会影响月经的,如果是卵巢巧克力囊肿不仅会使月经紊乱,还会引起痛经甚至不孕等。如果是恶性囊肿,也是会导致月经不调、痛经等症状的。当检查出囊肿且出现月经不调时,建议前往医院行相关化验检查,尽早明确诊断,选择最佳治疗方式。