巧克力囊肿是否严重,需要看巧克力囊肿的大小,以及有没有宫腔炎症、粘连、或者是水肿等。如果小于1-2cm的巧克力囊肿,并且没有炎症、粘连、水肿等,就说明不严重;如果巧克力囊肿大于2cm,或者有炎症、水肿、粘连等,就说明严重,有可能引起不孕的发生,多数有慢性盆腔痛。超过2cm的巧克力囊肿,或者是长期性生活不能怀孕,并且排除其他因素引起的不孕,就需要进行手术对巧克力囊肿切除,目前临床上主要使用腹腔镜手术,切除以后还需要定期复查,看是否复发。