巧克力囊肿的病因包括遗传因素、免疫因素、淋巴及静脉散播学说、体腔上皮化生学说以及经血逆流异位种植学说。
巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种,其发生具有家族聚集倾向,所以部分患者可能是因为遗传因素而导致。
如果女性体内免疫系统发生异常,由于无法将宫腔外的子宫内膜细胞消除,所以可发展为巧克力囊肿。
如果盆腔部位出现异位病灶,向远处种植、转移,可引起巧克力囊肿。
因多种因素的作用,可造成子宫内膜组织分化,而发生巧克力囊肿。
正常月经含有子宫内膜碎片,从宫腔向阴道流出。如果发生经血逆流,就可引起巧克力囊肿。