三个月不来月经的原因可能是怀孕,内分泌功能失调,器质性病变,绝经等。1、育龄期妇女且有性生活者,首先应当考虑是否有怀孕的可能,建议去医院在医生的指导下进行检查。2、内分泌功能失调,如高催乳素血症,先天性肾上腺皮质增生症,多囊卵巢综合症,甲状腺功能异常等会引起3个月不来月经。3、器质性病变,如子宫内膜破坏,盆腔占位性病变,肿瘤等,需要去医院做检查进行诊断治疗。4、若患者年龄在45到55岁左右出现三个月不来月经,且无其他不适症状,可能是围绝经期表现。