巧克力囊肿的病因主要包括以下几方面。
正常月经血含有子宫内膜碎片从宫腔向阴道流出,经血经宫腔向输卵管逆流种植于盆腹腔,并在种植部位继续生长、侵袭并蔓延,形成盆腔子宫内膜异位症,如果种植在卵巢,就形成了巧克力囊肿。
卵巢生发上皮是由具有分化能力的体腔上皮分化而来,在多种因素的作用下化生为子宫内膜组织。但化生是由已经分化成熟的组织转化为另一种分化成熟的组织,无法证实已分化的子宫内膜可以维持其继续分化的能力,故该学说仍无法解释巧克力囊肿是怎样维持存在。
巧克力囊肿的发病具有家族聚集倾向。如母亲或姐妹患有巧克力囊肿,则子代女性患巧克力囊肿的风险可提高七倍。
医源性播散是使子宫内膜异位症发生率增高的一个重要原因。剖宫产、人工流产手术、宫腔镜及腹部手术等,将子宫内膜带到盆腔异位种植,可诱发巧克力囊肿。