部分脑血栓的患者会引起后遗症。大部分的脑血栓病情较轻或者仅有少许的微血管的堵塞,并不会遗留下后遗症。如果脑血栓的面积相对较大,而且没有得到有效地治疗,会遗留后遗症。根据梗塞的部位的不同引起的症状也不同,如果为基底节区的梗死,可以遗留面瘫、舌瘫、偏身感觉障碍,如果累及内囊区还可以出现偏盲。如果患者的梗塞部位在小脑,这个表现为共济失调、头晕、行走不稳,醉酒样步态。如果脑血栓的部位出现在大脑皮层,会遗留肢体偏瘫、言语不利、肢体麻木或者没有知觉,患者会出现思考、记忆力等脑功能的下降。