卵巢巧克力囊肿可以结合病情的严重程度、囊肿大小、年龄以及对生育能力的要求等多方面因素来决定治疗方式。如果卵巢巧克力囊肿病情比较轻微,患者只是轻微痛经,囊肿的体积也比较小,并不用采取治疗措施,只要定期到医院复查,明确囊肿是否有增大的现象即可。如果囊肿体积已经超过三厘米,有生育需求,可以结合身体情况采取保守性手术或者半保守性手术。保守性手术主要是保留子宫的生育能力,将增大以及破坏的病变去除。而半保守性手术主要是控制疼痛以及保留卵巢功能。