射精后腰部疼痛常见的原因有以下几个:1.性交时性交的姿势不当,导致腰背部的肌肉劳损。如果是这种原因所致,建议患者适当调整性交的姿势,可以有效的避免性交后的腰疼的发生。2.患者身体机能下降,因此在性生活之后会出现腰膝酸软、乏力的状况。在中医学里,身体机能下降导致的腰疼一般称为肾阳不固,一般采用温补肾阳的方法治疗,比如服用金匮肾气丸或右归丸等药物,都可以有效地改善性交后腰疼的情况。建议在医生的指导下服用以上药物。