编者按:拷贝数变异(CNV)是由于基因组发生重排而导致的,是指染色体上大于1kb的DNA片段的增加或者减少。致病性CNV可导致一类重要的遗传病-基因组病,其临床表型复杂多变。在儿科领域,CNV检测已被作为不明原因发育滞后/智力低下、孤独症伴(或不伴)多发畸形患儿的一线检测方法,目前也被作为针对超声发现结构异常的胎儿进行产前诊断的重要遗传学检测方法。今天就来分享一篇产前诊断CNV的应用的相关文章,希望能对大家有用~
拷贝数变异(CNV)是由于基因组发生重排而导致的,是指染色体上大于1kb的DNA片段的增加或者减少。致病性CNV可导致一类重要的遗传病-基因组病,其临床表型复杂多变。在儿科领域,CNV检测已被作为不明原因发育滞后/智力低下、孤独症伴(或不伴)多发畸形患儿的一线检测方法,目前也被作为针对超声发现结构异常的胎儿进行产前诊断的重要遗传学检测方法。
目前用于CNV检测的技术主要包括染色体微阵列分析(CMA)以及基于下二代测序技术的拷贝数变异测序(CNV-seq)。根据芯片设计与检测原理的不同,CMA检测芯片又分为基于微阵列的比较基因组杂交(CGH芯片)及单核苷酸多态性微阵列(SNP-array)。以下来简单介绍各种检测方法的适用情况:
首选CMA(SNP-array
(1)无法排除胎儿存在产前单亲二倍体(UPD)。
(2)胎儿宫内生长受限。
(3)可能与UPD相关的超声软指标:胎儿长骨小于同孕周第5个百分位。
(4)孕妇外周血胎儿游离DNA产前筛查(NIPS)提示6、7、11、14、15及20号染色体异常。
CNV检测(CMA或CNV-seq均可)
(1)超声检测提示胎儿存在一处或多处结构异常。
(2)颈后透明层(NT)大于等于第99个百分位(NT大于等于3.5mm)。
(3)和CNV相关性较高的超声软指标:如右锁骨下动脉迷走。
(4)当NIPS提示除6、7、11、14、15及20号染色体以外的其他染色体异常。
(5)当胎儿染色体核型分析存在染色体新发平衡性改变。
(6)胎儿染色体核型分析无法明确诊断(如检测出标记染色体、衍生染色体等)时。
(7)夫妻一方为染色体微缺失/微重复综合征患者,或既往有染色体微缺失/微重复综合征妊娠史或生育史。
(8)夫妻一方为染色体平衡重排携带者时,在充分知情同意情况下,可同时行胎儿染色体核型分析和CNV检测。
(9)既往有不明原因的不良孕产史。
CNV检测或染色体核型检测
(1)孕妇高龄或常见胎儿染色体非整倍体筛查结果提示高风险。
(2)第95百分位小于等于NT小于第99百分位(3.0m小于等于NT小于3.5mm)。
(3)与染色体非整倍体相关性较高的超声软指标:如NF增厚、鼻骨缺如或发育不良。
(4)夫妻一方为染色体非整倍体(含嵌合型)患者,或具有常见染色体非整倍体妊娠或生育史时。
(5)因其他原因需要进行介入性产前诊断的孕妇(如夫妻双方同型地中海贫血),在充分知情同意情况下,可同时行胎儿染色体核型分析或CNV检测。
作者:郭艳平
来源:西交一附院妇产科公众号
参考文献:
中华预防医学会出生缺陷预防与控制专业委员会,中国优生科学协会基因诊断与精准医学分会,胡婷,等.拷贝数变异检测在产前诊断中的应用指南[J].中华医学遗传学杂志,2020,37(9):909-917.DOI:10.3760/cma.j.cn511374-20200522-00373.