引起妇科囊肿的原因有多方面,包括卵巢囊肿、黄体囊肿、卵巢巧克力囊肿、滤泡囊肿以及输卵管囊肿等。对于卵巢囊肿出现的原因主要是受到女性体内激素分泌出现失调的关系,特别是女性在日常生活中不规则饮食、长期过量服用富含有雌激素药物,会造成体内激素分泌失衡,卵巢部位受到长期刺激下会有囊肿生长。当子宫内膜并没有产生周期性脱落随经血一起排出,可能会在局部器官或者子宫局部组织内停留时间过长,从而引起囊肿发生,例如巧克力卵巢囊肿等。