不同类型的卵巢囊肿治疗原则不同。功能性囊肿一般不需要治疗,不管用药与否,通常会在三个月内自行消失;出血性囊肿一般不需要治疗,也会自行消失,但是时间较长,少数囊肿较大有压迫症状或存在囊肿扭转时考虑手术治疗;浆液性上皮囊肿及黏液性上皮囊肿一般不会自行消失,需要手术切除;巧克力囊肿会侵蚀卵巢组织,一般建议手术治疗;畸胎瘤不会自行消失,建议及早手术切除。