胚胎停育的原因比较复杂,和遗传因素、免疫因素、内分泌因素以及代谢等因素有关。其中夫妻双方以及胚胎染色体存在异常的概率比较大,胚胎停育发生的时间越早,染色体异常的概率会越高。其次,孕妇黄体功能不全或卵巢功能异常以及多囊卵巢综合征等,均可引起胚胎停育。胚胎停育刚发生时,有少部分孕妇可能并没有症状,因为在刚发生胚胎停育时,胎盘受精卵还会暂时性分泌人绒毛膜促性腺激素,但有部分女性会出现阴道流血、腹部疼痛,早孕反应逐渐减退或消失的情况。