做肠镜是否痛苦,取决于选择的肠镜的类型,主要如下:1、如果是普通肠镜,具有一定的痛苦,肠镜是通过一根可以弯曲的医学仪器,通过肛门直接进入直肠和结肠,当仪器进入体内后容易产生明显的不适感,可伴有腹痛或者腹胀等症状。2、如果选择的是无痛肠镜,检查时并不痛苦,检查前医生会注射麻醉药,所以检查时不会有痛感。肠镜主要适用于不明原因的下消化道出血、不明原因的慢性腹泻、不明原因的腹部疼痛、不明原因的腹部肿块等。