肛瘘手术后大便失禁的治疗方法有非手术治疗以及手术治疗。肛瘘手术后大便失禁,大多是由于手术时损伤过多的肛门括约肌所导致。大便失禁也分轻重,轻症的仅仅表现为气性或者液性的失禁,可以采取非手术治疗,患者需要注意饮食,避免刺激性食物,多吃纤维素含量丰富的食物,保持大便正常,避免腹泻以及便秘,可以口服一些补肾气的药物,平时加强肛门括约肌的锻炼。如果比较严重的大便失禁,比如成形的粪便也会失禁,无法控制,患者需要考虑手术治疗。