胚胎停育是否会自然流产,要根据孕妇的身体情况来判断。通常情况下,出现胚胎停育以后,多数孕妇会自然流产。但是,有部分患者会在停育两到三个月后,才会将胎儿排出体外,从而增加宫内感染的风险。而且胚胎停育发生在怀孕早期,胚胎在母体中长时间滞留,流产后会增加大出血的风险。所以胚胎停止发育后,不建议等待自然排出,可以到医院做B超等相关检查,确定胚胎停止发育,根据怀孕的孕周,在医生指导下采取相对应的方法终止妊娠。