肛门镜和肠镜主要的区别在于检查时能看到的范围不同。肛门镜的检查主要是了解肛管、直肠部位的疾病,大概能看到3到5厘米的距离。而肠镜的检查是可以检查整个大肠内部的情况,包括结肠和直肠部分,一直到回肠末端,大概到100厘米左右。肛门镜的检查不需要特殊的准备,排空肛管、直肠内粪便就可以做。而肠镜的检查需要喝清肠剂清空肠道的内容物,才能顺利完成检查。