肛瘘的形成原因可能和以下因素有关:
肛周脓肿经肛周皮肤行脓肿切开引流后,该切口可形成外口或自行破溃,从而导致肛瘘。
肛瘘多为化脓性感染所导致,少数为特异性的感染所致,如溃疡性结肠炎、克隆病、结核等。直肠肛管外伤继发感染也可形成肛瘘,直肠恶性肿瘤破溃也可形成肛瘘,但此种情况较为少见。
如外伤、食物中的骨头、吞咽金属等物品,均有可能会损伤肛管直肠,导致细菌侵入伤口,从而形成肛瘘。