肝胆结石的形成和环境、遗传、寄生虫感染、饮食、胆管先天发育异常、胆红素代谢紊乱等多因素相关。
在我国,肝胆结石的发病存在地域差异,北方地区的胆囊结石和胆固醇性结石较多,南方地区的肝内外胆管结石和胆色素结石较多,胆道内寄生虫、胆道反复感染、胆管先天发育异常会增加原发性胆管结石的发生,部分患者结石反复出现。
而肥胖、高脂肪饮食则和胆固醇结石的形成有一定相关,女性患者的结石发病率相对较高,如果胆囊结石掉入胆管则形成继发性胆管结石。合并慢性肝病,既往做过胃肠道手术的人群也容易出现肝胆结石。