胃肠道间质瘤可能会有以下各种并发症:1、肠梗阻。胃肠道间质瘤,肿瘤长到一定程度,体积较大的情况下,容易将肠管堵塞,引起肠梗阻。患者会出现肛门停止排气、排便,腹痛,腹胀等症状。2、消化道穿孔。恶性的胃肠道间质瘤,肿瘤发生破溃后有可能穿透肠壁,导致消化道穿孔的症状,出现突然发生的剧烈腹痛。3、消化道出血。间质瘤的瘤体破溃后会引起出血,表现为黑便、鲜血便的表现。4、转移性肿瘤。恶性胃肠道间质瘤中晚期时,有可能引起肝转移、肺转移等。