肾结石出现疼痛主要原因为:1、肾脏粘膜损伤:肾结石具有可移动性,肾结石在肾脏内移动会导致肾脏粘膜受到损伤以及出血,所以患者会觉察到肾脏区域有隐痛感。2、急性梗阻:肾结石若是卡在肾盂和输尿管交界部位,会导致肾脏里面的尿液无法通过输尿管及时排出体外,而在肾脏内处于高压状态,患者也会出现明显的肾绞痛。3、肾结石合并感染:肾结石合并感染,肾脏收到慢性炎症刺激,会引起肾被膜的充血、水肿,肾区也可能会出现疼痛感。