先天性心脏病手术一般不会留下后遗症。随着医疗手段的进步,目前先天性心脏病的手术治疗成功率很大,且术后恢复良好,基本不会留下后遗症,如果出现后遗症的情况,可能是术后康复过程中没有遵医嘱,不按时按量服用药物或护理不周等情况。常见的术后后遗症包括:1、伤口出血、感染,手术后要保持伤口的干燥,避免引起伤口发炎。2、房间隔缺损、室间隔缺损等修补封堵术后出现残漏,需要再次介入或手术治疗。3、损伤传导束,出现心律失常等,需要再次治疗。