嘴唇长黑斑主要原因为:1、胃肠道息肉综合征:该种疾病属于先天性遗传疾病,患者通常在幼儿时期发病。不过由这一诱因所致,通常会伴有腹痛等其他症状。2、色素痣:可以长在皮肤或黏膜上,如嘴唇等。3、固定性药疹:与药物过敏有关,患者经常习惯地口服某种药物。口服药物以后局部可能出现炎症性疾病或炎症性损害,停药以后局部留下色素沉着斑。此外,其他一些疾病,比如肾上腺皮质功能减退、阿狄森病等,也会导致患者嘴唇等部位出现明显的黑斑。