早孕期孕酮低主要原因是因为胚胎发育不好,因为早孕期大概流产的风险是12%左右,基本上十个人里有一个胚胎要注定流产,它主要表现就是孕酮低。妊娠早期体内容易出现黄体酮偏低,直接影响胎儿的健康发育,导致自然流产、先兆流产、宫外孕、早产、不孕、闭经。体内孕酮水平低的原因很多,也与卵巢黄体分泌不足有关。如果黄体功能不全,孕酮含量会相应降低。如果肾功能和甲状腺功能失调,也会影响卵巢功能,导致孕酮偏低,因此孕酮偏低需要就医检查一下具体的原因。