目前大部分的中枢神经系统感染是可以治好的。最常见的中枢神经系统感染类型是病毒性脑膜炎,具有自限性,给予正规的抗病毒治疗以后,大多数患者都可以在3周内完全好转,不留明显后遗症。病毒性脑炎相对严重一些,需要及早并长时间的抗病毒治疗,部分患者可能会遗留一些后遗症。化脓性脑膜炎是细菌感染导致的,此类疾病较凶险,但大多数对抗生素较敏感,治疗效果好,一般3~4周可治愈。结核性脑膜炎治疗周期较长,一般可能需要1~2年。隐球菌脑膜炎治愈率较低,患者死亡率相对较高。朊蛋白病患者最终都会死亡,无法治愈。