对于大部分正常人来说,做头部核磁检查是不痛苦的。因为核磁共振需要靠产生磁场才能完成,所以在检查之前要拿掉手机、硬币等含铁器物。核磁共振仪往往摆放在一个独立的房间,检查者平躺于检查床上后,会慢慢送入仪器中心部位,对应检查部位进行扫描。头部普通核磁共振大约需要15至20分钟左右,如果有特殊部位、特殊序列,检查时间会稍微长一点,40分钟也是有的。因为核磁检查是在一个狭长的空间里进行,对于患有幽闭恐惧症的人来说,就没有那么容易了。但是心理强大的人在克服恐惧后也是可以完成的。