绝大多数先天性心脏病一旦确诊,建议及早手术治疗。拖延的时间越长,对心脏功能的影响越大。房间隔缺损、动脉导管未闭的患者,在童年时期有可能没有明显的不适症状,但是如果不能得到及时有效的治疗,长时间也会引起心脏功能的改变、肺血管床的改变。小的房间隔缺损、室间隔缺损分流量小,虽不大可能影响心脏功能和肺血管床,但增加感染性心内膜炎的风险。少数先天性心脏病对血流动力学无影响者可等到成年以后再治疗,比如主动脉瓣先天性二叶瓣畸形,通常成年以后才会发生狭窄或关闭不全,才需要手术治疗。