在随诊12-30年时,经治疗的儿童癫痫3-5年发作缓解率为74%-78%。对于儿童期发病的癫痫患者,在随诊30年时,有64%的病例可以达到5年无发作,其中74%的患者摆脱了药物。
儿童癫痫的预后取决于其病因,新生儿良性发作、良性部分性癫痫包括,儿童良性癫痫伴中央颞区棘波、儿童良性枕叶癫痫等,以及婴儿良性肌阵挛癫痫以及某些有特殊原因促发的癫痫,通常发作稀疏,可以自发缓解,不一定需要药物治疗。儿童失神癫痫发作很容易用药控制,癫痫也有自发缓解的可能性。
各种癫痫性脑病、进行性肌阵挛癫痫和某些症状性或隐原性部分性癫痫则预后较差。