胚胎停育的原因有很多。环境因素、药物影响、孕妇情绪变化刺激等,都可能引起胎停育。激素分泌不足也是胎停育的一个原因,孕期需要孕激素、雌激素、HCG等激素,维持妊娠,如果激素分泌不足,比如黄体功能不全,会导致子宫内膜发育迟缓和黄体期短,影响受孕受精卵种植,或者早期流产。还有免疫原因,胎儿的是父母遗传物质的结合体,和母亲的不可能完全相同,母胎间的免疫不适应,引起母体对胎儿的排斥,常见的自身免疫性疾病有硬皮病、红斑狼疮等。