小儿肺炎的病因主要是毛细支气管或者是肺泡、肺间质受到外界致病菌或者是物理因素损害而导致的。
小儿肺炎大部分是感染致病菌所致,以病毒、细菌以及支原体等感染最常见,大部分是以支气管肺炎最常见。其次,比较常见的是间质性肺炎,大部分是病毒感染所致。小儿肺炎与小儿呼吸道黏膜以及结构、功能还没有发育成熟也是有一定关系的,一般随着年龄的增长,发生肺炎的概率逐渐的下降。
部分小儿肺炎主要是物理因素所致,尤其是异物吸入后导致的吸入性肺炎。