阴道内流出咖啡色分泌物的原因在不同的个体之间存在差异。子宫内膜感染性炎症、或者子宫内膜长了息肉、放置节育环引起子宫内膜无菌性炎症反应,都有可能导致患者的阴道内流出咖啡色的分泌物;在进入到女性的排卵期内发生排卵性出血,或者是在来月经前、月经刚结束的时候,子宫内膜不规则剥脱,也会引起阴道流出咖啡色分泌物的症状。子宫颈部位长了息肉、患了慢性炎症性疾病后出现宫颈糜烂,同样会导致咖啡色的分泌物。在排除了生理性因素的情况下,需要到医院检查后才能确定具体原因。