病毒性脑炎治疗后出现头疼的原因是病毒性脑炎导致患者出现脱髓鞘脑病,大脑白质的植物神经出现损害,其调节功能出现紊乱,造成支配区组织发生多样性的病理变化,以致患者出现头疼不适的症状。对于病毒性脑炎治疗后出现头疼的患者来说,可以在专业医生的指导下口服相关药物治疗的同时,建议配合中医针灸、理疗等相关辅助治疗,一般是可以缓解头疼的。此外,患者还要注意养成良好的生活习惯,保持情绪平稳,避免不良精神刺激,都可以在一定程度上缓解头疼症状。