指甲坑坑洼洼的原因有很多,具体如下:1、灰指甲:患者的指甲如果受到了真菌感染,就可能会出现表面坑洼不平或指甲增厚的表现,并且真菌感染的灰指甲还有一定的传染性,需要尽快在医生的指导下进行抗真菌治疗。2、银屑病:比较深的顶针状的凹陷,是银屑病典型的甲的改变。3、不规则的较大的凹点,可见于手部的湿疹,手部的扁平苔藓以及手癣等疾病。此外,某些患者出现甲凹点,可能与遗传因素有很大的关系。患者在身体缺乏微量元素之后,也可能会出现指甲坑坑洼洼的症状。