40天药流和人流都会对身体产生一定的影响。药物流产主要适用于停经49天以内的宫内早孕。但是现在大多数药物流产存在着药流不全,不能一次性流干净,如果宫腔的淤血或者机化的组织时间比较长,再次清宫对子宫内膜以及宫腔损害也比较大。人流是通过负压吸引术或者钳刮术的方式,清出妊娠组织及其附属物,其副作用是容易导致子宫穿孔,宫颈裂伤,人工流产综合征,出血,感染等情况。药物流产和人工流产各有利弊,根据自己的情况选择合适的终止妊娠的方法。