尖锐湿疣的复发次数没有确定的数字。这和个人的体质、生活习惯、病情的严重程度等等都有关系。免疫力好的患者接受正规治疗后可能一到三次就不复发,但是也有一部分患者可能复发次数会更多。少数患者表现为潜伏感染或亚临床感染。前者局部皮肤黏膜外观正常且醋酸白试验阴性,但通过分子生物学方法可检到HPV的存在,目前认为HPV潜伏感染是尖锐湿疣复发的主要原因之一;后者表现为肉眼不能辨认的皮损,醋酸白试验阳性,亚临床感染的存在和再活动也与本病复发有关。