尖锐湿疣的病原体是人类乳头瘤病毒(HPV),HPV病毒能耐受干燥并且可以长期保存,例如,在甘油中和-20℃时至少可以存活2-5个月。人体是人类乳头瘤病毒惟一的自然宿主,此病毒可以在人体存活的组织细胞内以复制的方式进行繁殖,无法在体外的组织培养和细胞培养中生长,也不能在实验动物中接种生长,离开人体无法存活。
人体温暖潮湿的条件下,人类乳头瘤病毒最易生存繁殖,所以外生殖器和肛周是最容易发生感染的部位。