肛周脓肿形成的主要原因是感染。
肛隐窝的开口向上,类似于一个口袋。当有粪便向下运动时,其周围很容易累积粪便。长期的粪便累积,使细菌大量繁殖,出现感染。肛线周围的肌肉淋巴引流十分丰富,感染可沿不同方向蔓延扩散,从而形成脓肿。
另一方面,一部分的可以导致肛周脓肿的感染可来源于肛门和直肠的手术或者是外伤造成的感染。还有一小部分可以继发于一些消化系统疾病,如克罗恩病、恶性肠道肿瘤或者是肠道结核。
还有一小部分感染可能是由于全身免疫系统要下降,如糖尿病、白血病、艾滋病等,这些疾病导致肛周抗感染能力下降,肛周本身的污染物就较多,所以肛周脓肿形成的可能性就会大大增加。