大部分口咽部肿瘤（63%）和几乎所有的肛门癌也和高危HPV的持续感染有关。WHO认定其中14种最具致癌潜能：16，18，31，33，35，39，45，51，52，56，58，59,66和68型。
若同一亚型的HPV病毒持续超过2年以上存在，称之为持续性感染，这才是需要警惕的。人乳头瘤病毒（HPV）感染能够引起子宫颈上皮内病变及子宫颈癌的发生，高危型别HPV的持续感染是促使子宫颈癌发生的最主要因素。
HPV检测为子宫颈癌及其癌前病变的常规筛查手段。有的女性在一年内可以自动清除，也有的女性是可以持续的感染。HPV16或HPV18阳性妇女发生高级别病变的风险高于其他型别。
