得了甲流以后咳嗽不停的原因可能与病毒的刺激、继发细菌感染有关，具体如下：

1、病毒的刺激

人体感染甲流病毒后，病原体会侵袭呼吸道黏膜，使炎性分泌物产生增多，进而刺激局部出现咳嗽症状。受损的呼吸道需要一段时间来恢复，因此咳嗽也会持续一段时间，如果自身抵抗力低下，或是没有及时处理，恢复时间可能会较长。

2、继发细菌感染

患者感染甲型流感病毒后，会导致机体的抵抗力降低，容易继发细菌感染，也容易加重咳嗽等症状。

如果咳嗽迟迟不好，建议可选择对症药物进行治疗，如连花清咳片，该药可以抗病毒、抑菌、抑制炎症反应，祛除各种病因，缓解咳嗽、咳痰等临床症状，并且还可调节机体免疫功能，加快病情恢复，减轻气道炎症反复发作所致的肺损伤，改善肺顺应性及呼吸功能。